En tidig höstmorgon är Isak på väg till biblioteket med sin skolklass för ett studiebesök. Klassföreståndaren har planerat en uppgift för eleverna som de ska göra och på så vis lära sig saker som kommer gynna dem inför provet. Men besöket tar en väldigt mystisk vändning för Isak, vilket leder till att han istället lär sig saker som hans egna lärare inte har en aning om. Hans upplevelse blir full av lärdom och för även med sig ansvar som han måste uppfylla i framtiden.

Isak och det mystiska biblioteket är Sebastian Abdul-Salaam Blascos tredje bok och hans första barnbok.